A estruturação operacional do Quadro de Referência Estratégica Nacional (QREN) é sistematizada através da criação de Programas Operacionais Temáticos e de Programas Operacionais Regionais para as regiões do Continente e para as duas Regiões Autónomas.

Os Programas Operacionais Temáticos são os seguintes:

- Programa Operacional Temático Factores de Competitividade (FEDER);
- Programa Operacional Temático Potencial Humano (FSE);
- Programa Operacional Temático Valorização do Território (FEDER e Fundo de Coesão).

Os Programas Operacionais Regionais do Continente, estruturados territorialmente de acordo com as NUTS II, são os seguintes:

- Programa Operacional Regional do Norte;
- Programa Operacional Regional do Centro;
- Programa Operacional Regional de Lisboa;
- Programa Operacional Regional do Alentejo;
- Programa Operacional Regional do Algarve.

Os Programas Operacionais das Regiões Autónomas, apoiados financeiramente pelo FEDER e pelo FSE, são os seguintes:

- PROCONVERGENCIA - Programa Operacional dos Açores para a Convergência
- PRO-EMPREGO - Programa Operacional do FSE para a R.A. dos Açores
- INTERVIR+ - Programa Operacional de Valorização do Potencial Económico e Coesão Territorial da RAM
- RUMOS - Programa Operacional de Valorização do Potencial Humano e Coesão Social da RAM

São também instituídos dois Programas Operacionais de Assistência Técnica ao QREN, com financiamento comunitário assegurado pelo FEDER e FSE:

- Programa Operacional de Assistência Técnica - FEDER;
- Programa Operacional de Assistência Técnica – FSE.

Para saber mais sobre os incentivos às empresas, visite www.incentivos.qren.pt.